可随时检查DNA的USB设备

梦飞扬

USB检测DNA

英国公司Oxford Nanopore最近开发出一款名为MinION可便携使用的基因序列检测机，这款基因序列检测机由一个传感器芯片，专用集成电路和一个完整的单分子感应测试所需的流控系统构成。
       人类基因工程结束以来的九年里，基因序列检测变得越来越快，越来越便宜，如此快的发展速度比得上计算机产业。这家英国公司从计算机产业中得到了启示，通过一群快速个体节点进行运算的模式，使得运算规模更易管理，所以，USB驱动的便携版本应运而生了。
        该公司的目标是使基因测序大众化，并且改变目前基因分析花费仍然十分昂贵的现状，让DNA测试和蛋白质测试就像用压舌板做检测那样简单容易。
        Oxford Nanopore公司，采用的技术名字和公司名一样，都是纳米孔（Nanopore）。他们使用纳米孔检测系统找出分子并进行分析。所谓纳米孔是一种固定在聚合膜上，中间有孔洞的有机分子。该聚合膜的电场使得成串的基因序列可以从纳米孔中穿过，孔洞中的电流变化将进行分析，并与碱基对匹配。
         该公司将此设备用在两个系统上，其中一个是GridION系统，该系统由数个充满可任意使用的测试盒（cartridge）的节点构成，每个盒内又包含了多个纳米孔。另外一个就是为了便携和能够分析个体分子所设计的MinION基因检测仪。
         每个GridION的节点和测试盒，最初的设计规模都是每天传输万兆字节的数据量。一开始，公司为每个盒内配备2000个纳米孔，但最后还是采用了20个节点，8000个纳米孔的配置，这样才有可能在15分钟内完整传输一个人的基因。
         MiniON非常小，6小时内可快速测序1.5亿对碱基对。它与其他实验室测试类似，都是利用血液，血浆，和血清进行样本分析，并且不需要聚合酶链反应来进行增幅。该公司将在今年晚些时候开始销售此设备，定价为900美元。
        应用这项技术进行检测是如此之快，花费却不到1000美元，对普通人来说，基因测序可能将不再是梦。